冷藏车的制冷机组可分为非独立制冷机组与独立制冷机组两种。非独立制冷机组一般情况下，专为单车厢厢式货车和中型卡车的低温和中等温度应用而设计的。而独立制冷机组则多用于大型冷藏车及半挂冷藏车，它配备有一个副发动机。
冷藏车的制冷机组是通过卡车发动机驱动压缩机运行，进行制冷和除霜。并可根据用户需要，冷藏保温车厢品牌，选配由电动机驱动的压缩机运行进行制冷和除霜（简称备电装置）。该系统至少由三大独立部件组成：冷凝器、蒸发器和压缩机。压缩机安装在卡车发动机上并由其驱动。使用制冷软管或管道将冷凝器、蒸发器、压缩机和其它的部件连接起来。备电装置还有另外一台压缩机和一台电动机及油分离器等，以备以电源驱动运行。发动机压缩机通过皮带由发动机驱动运行。电源驱动压缩机和发动机驱动压缩机平行连接。电源驱动压缩机通过电机皮带驱动。冷藏机组和驾驶室空调压缩机都使用相同的制冷系统回路。
在运行时，单向阀将两台压缩机隔离开来。压缩机的运行由控制器控制。该装置在发动机运行中给冷藏车压缩机离合器供电或者启动电机，在电源驱动运行时给压缩机离合器供电。整个制冷系统由一个压力切断开关进行保护。
清洗冷藏车厢有两个作用，一是保持车厢内部的环境卫生，防止车厢内出现怪味。这个应该很好理解，冷藏车有点类似冰箱，如果不注意清洗，很容易有怪味。冷藏车经常装不同的货物，特别是鱼类、肉类等，每次运送完一次货物后就清洗一次车厢。
另一个作用是防止制冷机组的蒸发器风扇将杂质吸入到蒸发器盘管内，从而降低制冷机组的制冷效果，这也是为什么冷藏车用了几年后大家会感觉制冷效果不如开始好的原因之一。
冷藏车的地板一般都有一道道可以通风的凹槽，但是有的也没有，没有的话要用双面托板来装货，以保证地板底部的冷气流通。
货物堆放不能过高，不要高于出风口的平面高度。如果出风口前面被货物堵住或离货物太近，不但会波及货物的储运温度，还会波及冷冻机组的正常工作，龙岩冷藏保温车厢，影响车厢内的冷风循环，导致通风口附近的货物结冰，而其他地方的货物温度可能过高。
而且制冷机组一般都带有空气感应除霜设计，货物离出风口太近时，出风口附近结冰，机组会迅速进入除霜状态，温度回升，除霜立即结束，反复此动作，而车厢内的温度确降不下来。
运输蔬菜水果时更要注意，蔬菜水果等由于会产生呼吸热量，冷藏保温车厢经销，如果冷气的循环不好，冷藏保温车厢规格，车厢中央部分的温度便会上升，从而导致货物品质出现问题。还有，距离出风口较近的上部货物应先盖上予罩布等以保护，防止冻伤。
经常清洗冷藏车厢保持车厢内部的干净清洁
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