药物残留是影响肠衣出口的主要障碍。食品安全是一项系统工程。肠衣生产涉及动物养殖、屠宰、加工、运输等各个环节，在加工环节由于各不同卫生要求的加工场所相对隔离，卫生预防措施控制有效，在加工环节肠衣发生药物二次污染的可能性小，猪肠衣的药物残留阶段关键还在于动物养殖。鉴于我国国情，当前我国千家万户的动物养殖模式在今后一段时间内仍将存在，肠衣原料l药物残留现象仍是今后出口肠衣检验检疫的一大重要隐患。
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肠衣加工企业注册卫生规范
卫生质量体系运行的要求
1企业应配备足够数量的、具备相应资格的专业人员从事卫生质量管理工作。
2企业应制定原料、辅料、半成品、成品及生产过程卫生控制程序，猪肠衣批发商，并有效执行，做好记录。
3企业应建立并执行卫生标准操作程序并做好记录，对影响肠衣卫生的关键工序，企业应制订明确的操作规程并进行有效的监控。
4企业应制定和执行对不合格品的控制制度，制度包括不合格品的标识、记录、评价、隔离处置、纠偏措施和追溯性等内容。
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洗净后的肠衣，用气泵吹气，猪肠衣供应商，使肠衣膨胀。置于清水中，检查肠衣有无漏洞，嘉定猪肠衣，最后挂在通风处晾干。干燥后在肠衣一头用针刺孔使空气排出，再均匀地喷上水，用手工或压肠机将肠衣压扁，包扎成把。加工后的肠衣应经常检查，猪肠衣哪家好，防止变质。
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