世界是繁多的物质中，凡是在一定条件下能产生相态变化，并伴随着热量授受关系的物质，都可以作为制冷剂。但从技术、经济、安全等方面考虑，真正实用的并不多。而在药品冷藏运输用制冷机中，能选作制冷剂的就更少了。
常用的药品冷藏车制冷剂根据它们的热力学、物理学、化学性质及组成，一般可以分为以下几类：
氟利昂制冷剂 氟利昂类制冷剂化学性能稳定、可燃性小、惰性大、基本无毒，只是在与明火接触时才才会分解出有毒的光气。氟利昂类制冷剂的广泛应用，二手冷藏车，促进了药品冷藏保温车制冷技术的发展。
无机化合制冷剂 这类制冷剂有氨、水=空气、二氧化碳等，其中氨的应用最为广泛。氨用作制冷剂，其压力适中，单位容积制冷量大、价廉，在路用冷库和海上鱼船中采用较多。
碳氢化合物制冷剂 用作制冷剂的碳氢化合物有乙烷、乙烯、丙烷、丙烯等，通常在石油、化工部门的制冷装置中采用。丙烷、丙烯用于两极压缩制冷，或用与重叠式制冷系统的高温部分，而将乙烷、乙烯用作低温部分，者类制冷剂凝固点低、价廉，但安全性能差。
混合制冷剂 是由两种或两种以上的制冷剂，按一定比例溶解而成的一种混合物。它在取某一区间低温时，能获得比单一化合物更优良的循环运行性能。
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